באוקטובר 1988 חזרה הקליק לשלוש הופעות איחוד במועדון "זמן אמיתי", שהיו מפוצצות בקהל ומצליחות מאוד אמנותית. אברמוב עיבד והפיק מוסיקלית, דני רכט הפיק ל"אדר הפקות" ואולפן "די. בי." הקליט, עם בן-טל כאחראי על הפקת הסאונד. המופע יצא באלבום הקליק 1988 - הופעה בתל אביב בהוצאת "אוזן בום צ'ה" ונכללו בו בין השאר "כל האמת", "אמא אני לא רוצה להיגמל", "מונדינה", "אל תדליקו לי נר", "שעת הזאבים", "ילדה מפונקת", "גולם" ו"אינקובטור". הופעות האיחוד הוכיחו שהלהקה לא איבדה מאיכותה בחמש השנים שלא ניגנה, ובכל זאת לאיחוד הזה לא היה המשך. דותן חזר לעיסוקיו הלא מוסיקליים, אברמוב חזר לחו"ל, גולדברג המשיך להיות נגן מבוקש ואפרת הפך למוסיקאי משפיע ביותר, כמפיק מבוקש וגם כמלחין.
ב-1995 יצא אלבום סולו ראשון של דני דותן, כל האהבות האסורות, אותו עיבדו והפיקו חבריו לקליק אברמוב ואפרת.
ב-1999 חידשו דותן, אברמוב ואפרת (עם גולדברג בסמפולים) את הקליק והקליטו שלושה שירים שכתב דותן והלחין אברמוב, "ארץ ישראל 2000", "סיבוב הגלגל" ושיר שנוצר לקראת הבחירות (וכלל סמפול של ראש הממשלה, ביבי נתניהו), "מילים זולות". 

ב-2000 הקליטה הקליק אלבום חדש. עד אמצע 2001 הוא לא יצא. באמצע 2001 הוציאה דנה אינטרנשיונל אלבום חדש שחלק גדול משיריו נכתבו על ידי דותן ואברמוב.

ב-2002 בישרה הלהקה על הוצאת קופסה מהודרת הכוללת את האלבומים אמא אני לא רוצה להיגמל ועולם צפוף. עוד בקופסה, דיסק שלישי עם שירים חדשים ("ארץ ישראל 2000" ו-"הכול מושלם") ונדירים, ואת הקליפ של "אל תדליקו לי נר".
ב-2004 הודיעה הלהקה על מופע איחוד. לאחר חודשיים של חזרות, השיקה הלהקה מופע בכורה במועדון הבארבי, בהרכב מלא (כולל גולדברג, שהגיע לארץ ממרסיי), בתוספת הקלידנית והזמרת יסמין אבן.